28 Mayıs – 30 Ağustos 2013 tarihlerinde gerçekleşen Gezi Parkı protestolarını organize ettikleri suçlamasıyla, aralarında sivil toplum ve iş insanı Osman Kavala’nın da bulunduğu, gazeteci, yazar, avukat, oyuncu, mimar, sivil toplum kuruluşu çalışanlarının yer aldığı 16 kişi hakkında iddianame düzenlendi. “Türkiye Cumhuriyeti hükümetini ortadan kaldırmaya veya görevini yapmasını engellemeye teşebbüs etme” suçlaması da dahil çok sayıda suçlama iddianamede yer aldı.

Berkin Elvan(14) Taksim Gezi Parkı Protestoları sırasında polisin attığı gaz fişeğiyle başından yaralandı. Hastanede 268 gün boyunca yaşam mücadelesi veren Elvan 11 Mart 2014'te hayatını kaybetti. Bir polis memuru hakkında “olası kast ile adam öldürmek” suçlamasıyla iddianame düzenlendi.

Yayımladığı ve yarışmalara katıldığı muhtelif şiirler nedeniyle şair Meral Şimşek hakkında “terör örgütü propagandası yapmak” ve “terör örgütü üyeliği”  suçlamalarıyla dava açıldı.

Diyarbakır Barosu, 28 Kasım 2015’te bir basın açıklaması düzenledi. Saat 10.30 sularında Baro Başkanı Tahir Elçi tarafından yapılan açıklamada, Türkiye toplumunun Afganistan, Irak ve Suriye’deki insanlığın tarihi mirasına yönelik bombalamaları kederle izlediği vurgulandı; çatışmaların bu kez de Diyarbakır’ın tarihi mirasına zarar verdiği ifade edildi. Açıklamanın ardından saat 11:00 sularında Tahir Elçi, Sur sakinleriyle konuşmaya başladığı sırada silah sesleri duyuldu. Çıkan çatışma sırasında Tahir Elçi vurularak öldürüldü.

Sivil toplum çalışmaları ile tanınan Osman Kavala, Gezi Protestoları ile ilgili yargılanırken hakkında yürütülen diğer bir soruşturmada muhtelif tutuklama ve tahliye kararları verildi. Osman Kavala, Gezi Parkı protestolarıyla ilgili davada beraat ettiği gün bu soruşturma kapsamında gözaltına alındı ve ardından tekrar tutuklandı.

Büyükada’da gerçekleştirilen rutin bir insan hakları çalıştayına katılan on hak savunucusu, 5 Temmuz 2017’de polis baskını ile gözaltına alındı. 13 gün süren gözaltı sürecinin ardından, içlerinde Uluslararası Af Örgütü Türkiye Direktörü İdil Eser’in de bulunduğu altı kişi 18 Temmuz’da; iki kişi ise 23 Temmuz’da tutuklandı.

ODA TV Ankara Haber Müdürü Müyesser Yıldız, Türkiye’nin sınır ötesi operasyonları hakkında yazılar yazdı, bu kapsamda muhtelif askeri kaynaklarla irtibat kurdu, fikri takip yaptı. Yıldız haber kaynaklarıyla gerçekleştirdiği görüşmeler ve yayımladığı haberler nedeniyle gözaltına alındı, tutuklandı.

Çorlu Tren Faciası'nda hayatını kaybedenlerin yakınları facianın üst düzey sorumluları hakkında yaptıkları suç duyurularından sonuç alamamaları üzerine Anayasa Mahkemesi'ne başvurdular. Faciada hayatını kaybedenlerin aileleri ve milletvekillerinin de aralarında bulunduğu AYM önündeki kalabalığın yapmak istediği basın açıklamasına polis müdahale etti.

Libya’da hayatını kaybettiği ifade edilen MİT mensubu kişilerin ölümleri ve düzenlenen cenaze töreni hakkında haber yapan  gazetecilere, "Devletin güvenliğine ve siyasal yararlarına ilişkin gizli kalması gereken bilgileri açıklamak, istihbarat faaliyeti ile ilgili bilgi ve belgeleri ifşa etmek” suçlamalarıyla dava açıldı.

Özgür Gündem gazetesinin mahkeme kararıyla 16 Ağustos 2016'da “geçici olarak” kapatılmasının ardından gazete binasına yapılan polis baskını sonrasında Aslı Erdoğan, Ayşe Necmiye Alpay, Filiz Koçeli, Ragıp Zarakolu, Bilge Aykut, Bilir Kaya, Eren Keskin, İnan Kızılkaya ve Kemal Sancılı hakkında gözaltı kararı verildi. Hak sahipleri hakkında "silahlı terör örgütüne üye olmak", "devletin birliğini ve ülke bütünlüğünü bozmak", "terör örgütünün propagandası" suçlamalarıyla dava açıldı.

Mart 2014 – Nisan 2016 tarihleri arasında Fuat Avni mahlasını kullanan bir Twitter hesabına ait bazı tweetleri T24 haber sitesinin haberleştirmesi hakkında, içeriklerden beş yıl sonra bir iddianame düzenlendi. Davada T24'ün kurucusu ve imtiyaz sahibi Doğan Akın “silahlı terör örgütüne üye olmamakla birlikte örgüte bilerek ve isteyerek yardım etmek” ile suçlandı.

İzmir'de yaşayan seks işçisi, trans kadın Hade Buse Şeker'in evine 9 Ocak 2019'da müşteri olarak gelen polis memuru V.H. evde silahla ateş açtı. Şeker, cinsel saldırı ve gaspa maruz bırakıldıktan sonra öldürüldü. V.H. Şeker'in evdeki arkadaşını da yaraladı.